تعمل جماعة العدل والإحسان بمؤسسات تتعدد بتعدد اختصاصاتها ومهامها التربوية والدعوية والتكوينية والسياسية وغيرها. وتقوم هذه المؤسسات بمهام التربية والدعوة والتكوين والتأطير والتعبئة، والتصدي لقضايا الشأن العام من سياسة وعمل اجتماعي وجمعوي وثقافي إشعاعي.
وفيما يلي الإطار العام لتنظيم جماعة العدل والإحسان:
- مجلس الشورى: وهو أعلى هيئة تقريرية عامة، ويضم منتدبين عن المؤسسات
- مجلس الإرشاد: وهو أعلى هيئة في الجماعة، تسهر على القيام بوظيفة الإرشاد والإشراف العام على سير الجماعة ومؤسساتها، يُنتخب على رأسه الأمين العام للجماعة.
- الهيئة العامة للتربية والدعوة: تشرف على سير وتتبع برامج التربية والتزكية والقرآن الكريم والتفقه الشرعي والعمل الدعوي والاجتماعي في صفوف الرجال.
- الهيئة العامة للعمل النسائي: تشرف على سير وتتبع برامج التربية والتزكية والقرآن الكريم والتفقه الشرعي والعمل الدعوي والاجتماعي في صفوف النساء.
- الدائرة السياسية: وهي جهاز متخصص في السهر على الشأن العام، يعنى بالعمل في مختلف الواجهات السياسية والحقوقية والاجتماعية والنسائية والشبابية والنقابية والأكاديمية..
- المؤسسات المحلية: وتتوزع جغرافيا ما بين الأقاليم والمناطق والجهات والشعب والأسر، وظيفتها تنزيل برامج الجماعة بمختلف تخصصاتها.